特別講義 「計算物理学：ソフトマターのシミュレーション」
０. はじめに [html]
0-1. プログラミングについて
0-2. 簡単な例題
0-3. まとめと演習
１．ソフトマターのシミュレーション
1-1. ソフトマターとは
1-2. 分子シミュレーション
1-3. 連続体シミュレーション
２．常微分方程式 [ノート：手書き]
2-1. Euler法
2-2. Leap-Frog法
2-3. Runge-Kutta法
2-4. Predictor-Corrector法
2-5. Symplectic法 （コメント [pdf]）
2-6. まとめと演習 [html]
３．偏微分方程式 [ノート：手書き]
3-1. Elliptic（楕円型）方程式
3-2. Hyperbolic（双曲型）方程式
3-2-1. Simple method
3-2-2. Lax method
3-2-3. その他の方法
3-3. Parabolic（放物型）方程式
3-3-1. Simple method
3-3-2. Dufort-Frankel method
3-3-3. Crank-Nicholson method
3-4. まとめと演習 [html]
４．行列演算 [ノート：手書き]
4-1. Poisson方程式
4-1-1. Fourier変換を用いる方法
4-1-2. 行列を用いる方法
4-2. 連立１次方程式と逆行列
4-2-1. 直接法（LU分解法）
4-2-2. 反復法（Jacobi法、Gauss-Seidel法）
4-3. 行列の固有値に関連した問題
4-3-1. 行列の型とアルゴリズム
4-3-2. シュレディンガー方程式
4-3-3. 対称行列のJacobi変換
4-4. 線形数値演算パッケージLAPACK[html]
4-5. まとめと演習 [html]
５．モンテカルロシミュレーション [ノート：手書き]
5-1. カノニカルアンサンブル
5-2. メトロポリスの方法
5-2-1. 粗いサンプリング
5-2-2. Importance（重み付き）サンプリング
5-2-3. メトロポリスの方法
5-2-4. マルチカノニカルサンプリング
5-3. 液体のモンテカルロシミュレーション
5-3-1. 周期境界条件
5-3-2. ビリアル定理
5-3-3. 相互作用の打ち切りと長距離補正
5-4. まとめと演習 [html]
６．分子動力学シミュレーション [ノート：手書き]
6-1. 位相空間積分と時間積分
6-2. 運動方程式（ミクロカノニカル：E一定）
6-2-1. Verlet法
6-2-2. Leap-Frog法
6-3. 拡張系の運動方程式１（圧力P一定）
6-4. 拡張系の運動方程式２（温度T一定）
6-5. データ解析
6-5-1. 熱力学平均値
6-5-2. 輸送係数
6-6. まとめと演習 [html]
７．ソフトマターシミュレーションの最前線と将来
参考図書：